資料來源：SQLite權威指南-P003~P004
從某個角度來說，SQLite 最初的構思是在一條軍艦上進行的。SQLite 的作者D. Richard Hipp當時正在為美國海軍編制一種使用在導彈驅逐艦上的程式。那個程式最初是運行在Hewlett-Packard Unix (HPUX)上，後臺使用Informix 資料庫。對那個程式來說，Informix 有點兒太強大了。一個有經驗的資料庫管理員(DBA)可能需要一整天來對它進行安裝和升級，如果沒經驗，這個工作就可能永遠也做不完了。
2000 年一月，Hipp 開始和一個同事討論關於創建一個簡單的內嵌式SQL 資料庫的想法，這個資料庫將使用GNU DBM B-Tree library (gdbm)做後臺，同時這個資料庫將不需要安裝和管理支援。後來，當有些空閒時間時，Hipp 就開始實施這項工作，並在2000 年的八月份發布了SQLite 的1.0 版。
按照原定計劃，SQLite 1.0 用gdbm 來做存儲管理。但後來，Hipp 很快就換成了自己的B-tree，以支援事務和記錄按主鍵的存儲。隨著最初的升級，SQLite 在功能和用戶數上都得到了穩步的發展。在2001 年中期，很多專案——開源的或商業的——都開始使用SQLite。在那以後的幾年中，開源社區的其他成員開始為他們喜歡的程式設計語言編寫SQLite 擴展。SQLite的ODBC 介面可以為Perl、Python、Ruby、Java 和其他主流的程式設計語言提供支援，這證明了SQLite 有廣闊的應用前景。
2004 年，SQLite 從版本2 升級到版本3，這是一次大升級。主要目的是增加內置的對UTF-8、UTF-16 及用戶定義字元集的支援。While 3.0 was originally slated for release in summer 2005,America Online provided the necessary funding to see that it was completed by July 2004. 除國際化功能外，版本3 的其他新特性包括：經過修補的C API，更緊湊的資料庫檔格式(比原來節省25%的空間)，弱類型，大二進位物件(BLOB)的支援，64-bit 的ROWID，autovacuum和改進了的併發控制。儘管增加了這一系列新特性，版本3 的運行庫仍然小於240K 位元組。
Another improvement in version 3 was a good code cleanup—revisiting and rewriting, or
otherwise throwing out extraneous stuff accumulated in the 2.x series.SQLite 持續增長並始終堅持其最初的設計目標：簡單、彈性、緊湊、速度和徹底的易用。
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